Der Hauptsitz des Instituts befindet sich seit 1993 in der 1885–88 erbauten, unter Denkmalschutz stehenden Villa Bleuler an der Zollikerstrasse 32 in Zürich-Riesbach. Die Villa wurde von Alfred Friedrich Bluntschli, einem Schüler Gottfried Sempers, für Hermann Bleuler und seine Frau Emma Dorothea Bleuler-Huber entworfen. Bleuler war Korpskommandant und Mitglied des Schulrates des Eidgenössischen Polytechnikums, den er von 1888 bis 1905 präsidierte. 1902 ging das Haus an die Seidenindustriellen Carl und Annie Abegg-Stockar über. 1983 wurde die Villa von den Erben an die Stadt Zürich verkauft, von welcher es SIK-ISEA im Baurecht erwerben konnte.